Oznaczanie ilościowe białek - porównanie metod
Streszczenie
Różnorodność metod spektrofotometrycznych i wiedza na ich temat pozwala badaczowi
dobrać odpowiednią metodę do pomiaru białek uwzględniając specyficzność próbki i wyeliminować
czynniki zakłócające pomiar. Artykuł przedstawia najpopularniejszych siedem metod identyfikacji
białek.
Słowa kluczowe: analiza jakościowa i ilościowa białek, metody spektroskopowe identyfikujące
białka, pomiar w ultrafiolecie, pomiar w ultrafiolecie wg Whitakera i Granuma, metoda Bradford,
metoda Lowry, metoda Bensadouna i Weinsteina, metoda biuretowa, oznaczanie BCA
Wprowadzenie
Znanych jest wiele metod badania obecności i ilości białek w próbkach, większość z nich opiera
się na spektrofotometrii, wykorzystującej specyficzne własności białek. Metody różnią się między
sobą czułością, zakresem detekcji, a wpływ na wynik ma wiele substancji występujących dodatkowo
w badanych próbkach. Techniki wykonania poszczególnych metod są proste, mimo to badacze
uzyskują nie poprawny wyniki stosując jedną (często ulubioną ) metodę do wszystkich próbek.
Oznaczanie białka metodą pomiaru absorbancji w ultrafiolecie [1]
Metoda ta polega na wykorzystaniu pochłaniania światła przy długości fali =280nm przez
aminokwasy aromatyczne np. tyrozyny i tryptofanu, które występują w białkach. Doświadczenia
dowodzą, iż liczba aminokwasów odpowiadająca za absorbancję przy tej długości fali jest zbliżona dla
wszystkich białek enzymatycznych. Substancjami zakłócającymi są kwasy nukleinowe, których
maksimum absorpcji jest zbliżone =260nm. W próbkach zawierających obie substancje stosuje się
metodę Warburga i Christiana, gdzie pomiary wykonuje się pomiary przy obu długościach a stosunek
obu wartości absorbancji określa się literą F, która jest mnożnikiem rzeczywistej wartości absorbancji
przy 280nm (Równanie 1, 2).
= 1
= 2
Å‚
Wartości F są stałe i odczytuje się je z tabeli. Szczegóły metody zawarte są w literaturze [2]
Wartość iloczynu to stężenie białka wyrażone w [mgxcm-3]. Inny badacz (Kalckar) stwierdził, iż
wiarygodniejszy wynik dostaje się, gdy od wartość współczynnika F odejmuje się od absorbancji
uzyskanej przy 280nm [3].
= - 3
Å‚
Oznaczanie białka metodą pomiaru absorbancji w ultrafiolecie wg Whitakera i Granuma [1]
Metoda ta polega na pomiarze absorbancji przy dwóch długościach =235nm i =280nm, a
stężenie białka wylicza się z równania 4:
= 4
Å‚
,
Gdzie:
2,51 jest różnicą pomiędzy średnimi wartościami absorbancji przy =235nm (3,89ą0,59) i
=280nm (1,38ą0,62) dla 0,1% roztworów białek [4].
Metoda ta posiada wiele zalet: można stosować ją bez użycia wzorca, kwasy nukleinowe nie
przeszkadzają przy pomiarach, na jednej próbie można wykonać pomiaru przy obu długościach fali.
Należy jednak pamiętać, iż metoda ta nie jest czułą metodą.
Metoda Bradford
Metoda Melanii M. Bradford wykorzystuje fakt wiązania białka przez barwnik Coomassie
Brillant Blue (CBB) G-250. Pomiar odbywa się przy =595nm po związaniu barwnika z białkiem.
Natężenie barwy jest proporcjonalne do zawartości białka w roztworze. Metodę stosuje się do
detekcji białka w zakresie 20-1200źg białka/ml. Czułość metody wynosi 20 źg białka/ml [5]. Więcej
informacji na temat metody można znalezć w literaturze [6].
Metoda biuretowa [7]
Metoda ta wykorzystuje obecność wiązań peptydowych w rozmaitych związkach
organicznych, głównie w białkach i peptydach. Warunkiem koniecznym jest występowanie co
najmniej dwóch wiązań peptydowych bezpośrednio obok siebie lub przedzielonych nie więcej niż
jednym atomem węgla. Test biuretowy polega na dodaniu do analizowanej mieszaniny roztworu
silnej zasady oraz siarczanu miedzi(II). Jeżeli w roztworze obecne są związki zawierające bliskie
wiązania peptydowe, to roztwór zmienia barwę z niebieskiej na fioletową (=540nm). Jest to
spowodowane powstawaniem anionowych związków kompleksowych, w których jon Cu2+ jest
kompleksowany przez minimum dwie grupy peptydowe (Rysunek 1). W przypadku
występowania dimerów aminokwasów, w których występuje tylko jedno wiązanie peptydowe układ
zabarwia się na różowo. Wolne aminokwasy nie zmieniają barwy roztworu.
Rysunek 1 Kompleks biuretowy
Test może być stosowany zarówno w analizie jakościowej, jak i ilościowej. W tym drugim
przypadku wykorzystuje się liniową zależność zmiany barwy od stężenia protein, a w rzeczywistości
od liczby podwójnych wiązań peptydowych. Czułość metody 0,1 mgxcm-3, zakres 0,1 15 mgxcm-3.
Oznaczeniu przeszkadzajÄ…: sole amonowe (dajÄ… barwne kompleksy z jonami miedzi) oraz siarczan (VI)
magnezu (przechodzi w nierozpuszczalny wodorotlenek magnezu, który maskuje właściwą barwę)
Metoda Lowry i wsp. [8]
W metodzie tej wykorzystuje się dwie odrębne reakcje: reakcje aminokwasów
aromatycznych z odczynnikiem Folina oraz reakcję jonów miedzi(II) z wiązaniami peptydowymi
(reakcja biuretowa). W pierwszym etapie metody Lowry`ego zachodzi reakcja pomiędzy białkiem
(dokładnie atomami azotu wiązania peptydowego) a siarczanem miedzi i cytrynianem sodu
w środowisku zasadowym, co prowadzi do powstania kompleksu miedzi (Cu2+) i białka. Skutkiem tego
jest redukcja jonów miedzi do jonów Cu+. W kolejnym etapie, po dodaniu do mieszaniny reakcyjnej
odczynnika Folina-Ciocalteu (kompleksu kwasów fosfomolibdenowego (Mo6+) i fosfowolframowego
(W6+)). Aminokwasy aromatyczne redukują te jony do tzw. Błękitu molibdenowo-wolframowego, co
przejawia się zmianą barwy roztworu na niebieską. Zmiana barwy jest proporcjonalna do ilości
kompleksów miedziowo-białkowych. Zalety metody: niskie koszty, łatwość wykonania pomiaru.
Metoda ta od wielu lat jest najczęściej spotykaną procedurą określania zawartości protein
w nieznanej próbce. Pomiar wykonuje się przy =750nm, aby otrzymać wiarygodny wynik należy
stworzyć krzywa kalibracyjną. Do obliczeń wykorzystuje się tzw. Współczynnik kalibracji, który oblicza
się na podstawie wzoru (Równanie 5):
ł ó
= 5
Metoda Bensadouna i Weinsteina [9]
Metoda ta jest zmodyfikowanym oznaczeniem białek metodą Lowrego, wykorzystuje również
reakcje opisane powyżej, jednak do pomiaru przygotowuje się próbkę poprzez wytrącenie białka 5%
roztworem kwasu trichlorooctowego w obecności dezoksycholanu sodu co umozilwia pomiar białka
przy poczÄ…tkowym jego zanieczyszczeniu zwiÄ…zkami: Triton, sacharoza, glicerol, tris, siarczan (VI)
amonu, fenole, glicyna, Tricine itp. Pomiar wykonuje się przy 660nm również uwzględniając
współczynnik kalibracji.
Oznaczanie ilościowe białka z kwasem bis-cynchoninowym (BCA)
Metoda ta jest kolejnÄ… modyfikacjÄ… reakcji biuretowej. Kwas bicinchoninowy tworzy z jonami
miedziowymi stabilny kompleks, który maksimum absorbancji posiada przy =562 nm. Metoda ta ma
czułość i zakres porównywalny do metody Lowr ego. Podobnie jak pozostałe metody oparte na
reakcji biuretowej metoda ta wrażliwa jest na obecność związków redukujących np. kwasu
askorbinowego. Zasadniczo polega na reakcji redukcji jonów Cu2+ do Cu+ w alkalicznym środowisku
poprzez składniki białek (cysteina, tryptofan i inne).
Literatura
[1] Colowick S.P., Kaplan O. 1957. Methods In Enzymology. Vol.8: 451-454. Acad. Press, New
York&London
[2] Warburg O., Christian W. 1941. Biochem. 310: 384
[3] Kalckar H.M., Shafran M. 1947. J. Biol. Chem. 167: 465-275
[4] Gniot-Szulżycka J., Leznicki A., Komoszyński M., Wojczuk B. 2005. Białka. Materiały do ćwiczeń z
biochemii metody ilościowego oznaczania rozdziału i oczyszczania.
[5] Bradford M.M. 1976.A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of
protein utilizing the principle of protein-dye binding. Anal. Biochem. 7;72:248-54
[6] Wójciuk K. Ilościowe oznaczanie białka, czyli wszystko co powinniśmy wiedzieć o metodzie
Bradford. 2013. Labro Technologie
[7] Freeman H.C., Smith J.E.W.L., Taylor J.C.1961. Crystallographic studies of the biuret reaction. I.
Potassium bis-biuret cuprate(II) tetrahydrate, K2[Cu(NHCONHCONH)2]·4H2O. Acta Cryst. 14, s. 407-
418
[8]Lowry O.H.i wsp. 1951. Protein measurements with the Folin Phenol Reagent, J.Biol.Chem., 193:
267-275
[9] Bensadoun A., Weinstein D. 1976. Assay of proteins In the presence of interfering materials. Anal.
Biochem. 70:241-250
Wyszukiwarka
Podobne podstrony:
Tablica pomocnicza dla oznaczania ilości towarów przy zwolnieniu 1 1 3 6Badania porównawcze metod obliczanaia obciązenPorównanie metodAnaliza porownawcza metod oceny JEEOznaczanie ilosciowe w HPLCporownanie metod?zintegracji komorekSzablon zastosowanie metod ilosciowychCwiczenie nr Analiza ilosciowa Alkacymetria Oznacznie weglanow i wodoroweglanowfonetyczne porównanie dwóch metod estetycznego ustawienia zębównprzednich górnych w protezach sałkow2 Podział metod analizy ilościowej Analiza wagowaAnaliza porównawcza śladów zębów i cech zębów z wykorzystaniem metod 2D i 3DPotrzeby w zakresie nowelizacji znormalizowanych metod oznaczania substancji chemicznych na stanowisWalidacja metod analitycznych Cz II Oznaczanie jonów w wodach metodą chromatografii jonowejCwiczenie nr Analiza ilosciowa Kolorymetria Kolorymetryczne oznacznie? 3 , PO4 3więcej podobnych podstron