CCF20091118006

Biologia nowotworzenia - Ćwiczenie 5 i 6

- 'Oper',

'Color Separation',

- 'Red'.

2. Wyznaczyć granicę tła i kolagenu sposobem manualnym:

'Image',

'Set Thresholds'.

Opcję 'Smooth' dostępną w wyświetlonym oknie 'Set Thresholds' ustawiać zawsze na maksimum (32), aby zachować powtarzalność wyników. W ten sposób widoczne w oknie piki maksymalnie wygładzono tak, żeby możliwe było znalezienie punktu przecięcia się wykresu z osią X.

Pionowy suwak oznaczający granicę tła (Phase 1) i kolagenu (Phase 2) ustawić w miejscu przejścia wykresu przez oś X. W tym miejscu komputer powinien zaznaczyć dokładnie połowę tła (Phase 1) danego obrazu.

3. Wykonać automatyczną analizę obrazu:

'Measure'

'Phase Analysis'

Komputer wyświetli tabelę z wyznaczoną procentową zawartością tła (Phase 1) i kolagenu (Phase

2).

■ Wynik procentowej zawartości tła (Phase 1) wyznaczonej przez komputer pomnożyć x 2, pamiętając o tym, że pionowy suwak został ustawiony w miejscu przecięcia wykresu z osią X (połowa tła na obrazie).

■ Wynik procentowej zawartości kolagenu (Phase 2) otrzymujemy odejmując od 100% obliczoną zawartość procentową tła (Phase 1) na obrazie.

Sposób obliczania zawartości procentowej tła i włókien kolagenowych można przedstawić za pomocą następujących wzorów:

zawartość tła —> T = (Phase 1) x 2 = T

- zawartość włókien kolagenowych —> K = 100% - T

4. LITERATURA

1. Bańkowski E., W. Gałasiński: Biosynteza kolagenu, Postępy Biochemii 20 (1974): 481 -502;

2. Bańkowski E., J. Pałka: Polimorfizm molekularny kolagenu: kolageny typów VI - XII, Postępy Biochemii 35 (1989): 397-413;

3. Bańkowski E.: Polimorfizm molekularny kolagenu kręgowców. Postępy Biochemii 28 (1982): 301 - 330.

4. Dayan D., T. Waner, H. Tal, A. Nyska: Polarization Microscopy of Picrosirius Red - Stained Collagen from Oxodipine

- Induced Hyperplastic Gingiva of Beagle Dogs, Journal of Experimental Pathology 74 (1993): 225-228;

5. Junąueira L. C. U., G. Bignolas, R. Brentani: Picrosirius Staining Plus Polarization Microscopy, a Specific Method for Collagen Detection in Tissue Sections. Histochemical Journal 11 (1979): 447 - 455.

6. Kłyszejko - Stefanowicz L.: Cytobiochemia, PWN, Warszawa (1995);

7. Litwin J. A.: Podstawy technik mikroskopowych. AM im. M. Kopernika, Kraków (1989);

8. Montes G. S.: Structural Biology of tlie Fibres of the Collagenous and Elastic Systems, Celi Biology International 20 (1996).

9. Pickering J.G., R. Boughner: Quantitative Assessement of the Age of Fibrotic Lesions Using Polarized Light Microscopy and Digital Image Analysis. American Journal of Pathology, 138 (1991): 1225- 1231.

10. Pluta M.: Mikroskopia optyczna. PWN, Warszawa (1982);

11. Sawicki W.: Histologia. Wydawnictwa Lekarskie PZWL, Warszawa (1997).

12. Zawistowski S.: Technika histologiczna, histologia oraz podstawy histopatologii, PZWL, Warszawa, (1986);