* podobnie jak HDA wykorzystuje zjawisko powstawania heterodupleksów
* niesparowane zasady w heterodupleksach poddaje się modyfikacji chemicznej
(cytozyna - hydroksylamina, tymina - czterotienek osmu)
* zmodyfikowane cząsteczki DMA ulegają przecięciu pod wpływem piperydyny —* zmiany w obrazie elektroforetycznym