21417 infa2
Instrukcja do zadania II z Bioinformatyki (rok akademicki 2012/2013).
Celem zadania jest znalezienie i scharakteryzowanie białka, wraz /. opisem rodziny do której ono należy, na podstawie otrzymanej sekwencji.
1. Wykorzystując odpowiednie narzędzia i bazy danych sprawdź czy Twoja sekwencja to kompletne białko, czy tez. tylko jego fragment. Jeżeli jest to sekwencja kompletnego białka to podaj jego nazwę, jeżeli tylko jednej domeny, to również podaj jej nazwę lub nazwę rodziny ,
2. Zidentyfikuj wszystkie funkcjonalne domeny jakie można wyróżnić w Twojej sekwencji i je krótko opisz, (w kontekście Twojej sekwencji). Jeżeli zidentyfikowano kilka domen to szczegółowo opisz największą z nich wraz z charakterystyką rodziny do jakiej należy.
3. Wykonaj (i zamieść w raporcie) nałożenie 10 sekwencji (w tym Twojej) pochodzących z. różnych organizmów i zaznacz na tym nałożeniu (i krótko opisz) kilka istotnych <z punktu widzenia funkcjonowania opisywanej domeny) aminokwasów. Podaj odpowiednie odnośniki literaturowe.
4. Ile różnych białek zaw ierających sekwencję podobną do twojej (dla ł:.-value 0.0001) znany ch jest w komórkach ludzkich. Przedstaw wynik w formie tabeli zawierającej nazwę białka, i den ty łikator, długość sekwencji. % identyczności oraz h'.-va'lue
5. Znajdź strukturę Twojego białkadomeny i przedstaw w raporcie w stosownej reprezentacji (wraz z podpisem) zaznaczając na niej wszystkie istotne elementy (te same. o których była mowa w punkcie 3). Jeżeli nie znajdziesz struktury swojej sekwencji, u> zastąp ją strukturą reprezentatywną dla rodziny lub samodzielnie przygotowanym modelem
Raport należy przygotować w procesorze tekstu i dostarczyć w formie elektronicznej.
Pow inien on z.ac/.y nać się od podania imienia i nazwiska oraz tytułu raportu a następnie powinien zawierać numer wybranego zadania i zadaną sekwencję. W dalszej kolejności powinny znaleźć się wszystkie wymagane elementy opisane w punktach jw.
Wyszukiwarka
Podobne podstrony:
Prawo prywatne II RP Rok akademicki 2012/2013 Prof. dr hab. Dorota Malec Spis treści Wykład 1 - Part
PLAN STUDIÓW NA ROK AKADEMICKI 2012/2013 Rok studiów II liczba grup dziekańskich 5 Nazwa przedmiot
PLAN STUDIÓW NA ROK AKADEMICKI 2012/2013 Rok studiów II liczba grup dziekańskich 5 Nazwa przedmiot
HISTORIA ARCHITEKTURY ROK II SEM 3(ŚREDNIOWIECZNA ARCHITEKTURA POUSKI) rok akademicki 2012/2013 Prow
SYLABUSY KULTUROZNAWSTWO, STUDIA II STOPNIA, PROFIL PRAKTYCZNY, ROK AKADEMICKI 2012/2013 Nazwa
Rok akademicki: 2012/2013 Kierunek: Lekarsko Dentystyczny leci Rok studiów, semestr: II rok,
PLAN STUDIÓW NA ROK AKADEMICKI 2012/2013 Rok studiów II liczba grup dziekańskich 5 Nazwa przedmiot
PLAN STUDIÓW NA ROK AKADEMICKI 2012/2013 Rok studiów II liczba grup dziekańskich 5 Nazwa przedmiot
paszylk ROK AKADEMICKI 2012/2013 ST-1, ERok studiów II, semestr 4 ELKTROENERGETYKA (EL-EN) Labo
więcej podobnych podstron