*cracks knuckles*
A więc jest tak: Skynet faktycznie nie ma odpowiednich klatek animacji, aby używać minigunów czy ciężkich karabinów. Może używać każdej broni, która korzysta z klatek animacji strzelby - a więc Combat Shotgun, snajperki, gaussa itp. O ile się nie mylę, moze też używać dużych pistoletów, tych, które korzystają z animacji submachine gun - czyli pistoletu .223, HK P90c, HKG11E i temu podobnych.
Teoretycznie, chociaż nigdy nie próbowałem, mógłby tez używać borni używających animacji Unarmed, czyli Power Fist, Mega Power Fist... I rękawic bokserskich.
Co do problemu z zaatakowaniem:
Bot w Twojej drużynie to nie Skynet, ale tzw. Zły Skynet. Złego Skyneta dostajesz wtedy, gdy skłamiesz na pytanie o tożsamość (Przedstawisz się jako Kapral Dixon) lub zrazisz cybernetyka w czasie rozmowy przy terminalu (opcja dialogowa "It's nice to want", możliwe, że jeszcze jakaś). Wówczas Skynet jest na Ciebie zły i zaatakuje zaraz po wyjściu z bazy (rozwala też jednego z towarzyszy jakich masz, automatycznie, poza psami) .
Zły Skynet przyłączy się nawet, gdy masz pelną drużynę.
Aby tego uniknąć odloaduj i porozmawiaj z komputerem na 3 poziomie jeszcze raz.
EDIT: Aha, oczywiście B-Team Mod, bo o nim mowa, nie działa na SkyNeta