Optymalizacja PCR

* potencjalnie wiele zmiennych » każda para starterów musi być optymalizowana

Zwykle optymalizacji wymagają:

-    stężenia

• Mg²*    parametry

° starterów    krytyczne

*    matrycy

-    temperatura anneaiingu

-    czas wydłużania

Stężenie Wig²'¹'

⁹ jony magnezowe - kofaktor polimerazy DNA -► wpływ na aktywność enzymatyczną

³ stężenie zbyt niskie —> słaby produkt lub brak produktu

⁸ steżenie zbyt wysokie —> niespecyficzne produkty