7808335477
29.10.2015
Bioinformatyka, edycja 2015/2016, laboratorium 4
Instytut Informatyki I Matematyki Komputerowej UJ, opracowanie: mgr Ewa Matczyńska, dr Jacek Smietański
Przyrównywanie sekwencji
1. Porównywanie sekwencji - wprowadzenie
Sekwencje porównujemy po to, aby zidentyfikować miejsca podobne, które mogą świadczyć o powiązaniu ewolucyjnym czy funkcjonalnym obu sekwencji. Można również badać samopodobieństwo sekwencji.
AAB24882 TYHMCQFHCRYVNNHSGEKLYECNERSKAFSCPSHLQCHKRRQIGEKTHEHNQCGKAFPT 60
AAB24881 --------------------YECNQCGKAFAQHSSLKCHYRTHIGEKPYECNQCGKAFSK 40
AAB24882 PSHLQYHERTHTGEKPYECHQCGQAFKKCSLLQRHKRTHTGEKPYE-CNQCGKAFAQ- 116
AAB24881 HSHLQCHKRTHTGEKPYECNQCGKAFSQHGLLQRHKRTHTGEKPYMNVINMVK.PLHNS 98
Rysunek 1: Dopasowanie dwóch sekwencji motywów palca cynkowego u człowieka (ang. zinc finger domain), który jest rodzajem domeny białkow ej występującej w białkach wiążących DNA i bierze bezpośredni udział w związaniu cząsteczki kwasu nukleinowego przez białko.
W szczególności mówimy, że sekwencje są homologiczne jeśli wywodzą się od wspólnego przodka, tzn. że różnice między nimi są wynikiem różnicowania się w toku ewolucji.
Rysunek 2: Pojęcie homologii w biologii nie dotyczy tylko sekwencji, jest dużo szersze, przykład homologii kończyn u ssaków (jeden z argumentów Darwina za teorią ewolucji).
1
Wyszukiwarka
Podobne podstrony:
29.10.2015 Bioinformatyka, edycja 2015/2016, laboratorium 4 Możliwa jest również sytuacja, kiedy
29.10.2015 Bioinformatyka, edycja 2015/2016, laboratorium 4Zadanie 1. - Wejdź na
29.10.2015 Bioinformatyka, edycja 2015/2016, laboratorium 44. Algorytm LCS Ponieważ algorytmy
29.10.2015 Bioinformatyka, edycja 2015/2016, laboratorium 45. Algorytm Needlemana-Wunscha (dopasowan
29.10.2015 Bioinformatyka, edycja 2015/2016, laboratorium 4 Rysunek 4: Z materiałów do kursu
29.10.2015 Bioinformatyka, edycja 2015/2016, laboratorium 4Global Alignment vs. Local
Piekary Śląskie 29.10.2015 Radny Rady Miasta Piekary Śląskie Łukasz
Rok akad. 2015 / 2016 ELEKTROTECHNIKA Semestr 2 ZADANIA Z MATEMATYKI Zestaw 10 1.
6 10(1) 2015/2016 Piotr Bieranowski - ćwiczenia z WYTRZYMAŁOŚCI MATERIAŁÓW, CZ. VI. RRS: 0) =
Sesja VIII (Czwartek, 15.10.2015 r.)Jak wychowywać? Instytut Pedagogiki, Wydział Humanistyczny UPH,
Wykład ze Wstępu do Informatyki Rok 2015-2016 Marek Zawadowski Wydział Matematyki, Informatyki i Mec
Rok akad. 2015 / 2016 ELEKTROTECHNIKA Semestr 2 ZADANIA Z MATEMATYKI Zestaw 1 1. O
Rok akad. 2015 / 2016 ELEKTROTECHNIKA Semestr 2 ZADANIA Z MATEMATYKI Zestaw 11 1. Rozwiązać równanie
Rok akad. 2015 / 2016 ELEKTROTECHNIKA Semestr 2 ZADANIA Z MATEMATYKI Zestaw 3 1.
Rok akad. 2015 / 2016 ELEKTROTECHNIKA Semestr 2 ZADANIA Z MATEMATYKI Zestaw 4 1. Z
więcej podobnych podstron